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Mise à jour : 06-02-2018

Thème : Epigénétique et Maladies Rares

Notre équipe étudie le rôle joué par les modifications épigénétiques dans l'étiologie des pathologies héréditaires. Les modifications épigénétiques contrôlent plusieurs phénomènes biologiques et permettent à la cellule de mieux s'adapter à l'environnement grâce à une régulation fine et dynamique de l'expression des gènes. Lorsque cette régulation est altérée, elle peut générer une pathologie.

Nous nous intéressons à la mucoviscidose (CF), une maladie génétique qui résulte de l'altération de la protéine CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator). CFTR est un canal chlorure responsable du transport des ions à travers la membrane plasmique apicale des cellules épithéliales. La protéine défectueuse produit un mucus épais et obstructif dans les tissus épithéliaux à fonction secrétoire. Les patients CF présentent des infections pulmonaires récurrentes, une inflammation permanente, une insuffisance pancréatique et une infertilité masculine. La morbidité et la mortalité sont principalement dues à la perte progressive de la fonction pulmonaire. Très variable parmi les patients CF, la sévérité de l'atteinte pulmonaire est déterminée à parts égales par des facteurs génétiques et environnementaux.
En combinant des analyses génomiques, épigénomiques, bioinformatiques et statistiques, nous recherchons les facteurs non héreditaires responsables de la variabilité phénotypique qui caractérise les patients CF. Les objectifs spécifiques de notre activité de recherche sont :

  • déterminer si des modifications épigénomiques (méthylation de l'ADN) expliquent la variabilité phénotypique présentée par les patients CF ;
  • développer et valider des biomarqueurs épigénétiques pronostiques de l'évolution de l'atteinte pulmonaire, utiles pour le suivi des patients CF (projet labellisé IBDLR).

  • Personnel

  • Albertina DE SARIO (CR HC CNRS + HDR)

    Sylvie TAVIAUX (PH, CHU Montpellier)

    Enora FREMY (IE CDD Université de Montpellier, Bioinformatique)

    Laura BROSSEAU (Master 2, Université de Marseille)

    Elisabeth LATA (Master 1, Université de Bordeaux)

  • Mots clés : méthylation de l'ADN, chromatine, mucoviscidose, biomarqueurs, pyrosequençage, RNAseq, bioinformatique, cohorte de patients, biobanque

  • Accès

  • Publications sélectionnées
  • Magalhaes M., Tost J., Pineau F., Rivals I., Busato F., Alary N., Mely L., Leroy S., Murris M., Caimmi D., Claustres M., Chiron R., De Sario A. Dynamic Changes of DNA Methylation and Pulmonary Disease in Cystic Fibrosis: Lessons from a Monogenic Disease. Epigenomics, 2018 Jul doi: 10.2217/epi-2018-0005. PMID: 30052057

    Magalhães M, Rivals I, Claustres M, Varilh J, Thomasset M, Bergougnoux A, Mely L, Leroy S, Corvol H, Guillot L, Murris M, Beyne E, Caimmi D, Vachier I, Chiron R and De Sario A. DNA methylation at modifier genes of lung disease severity is altered in cystic fibrosis. Clinical Epigenetics. 2017 Feb 14;9:19. doi: 10.1186/s13148-016-0300-8. PMID: 28289476

    Bergougnoux A, Claustres M, De Sario A. Nasal epithelial cells: a tool to study DNA methylation in airway diseases. Epigenomics. 2015 Feb;7(1):119-26. doi: 10.2217/epi.14.65. PMID: 25687471

    Bergougnoux A, Rivals I, Liquori A, Raynal C, Varilh J, Magalhães M, Perez MJ, Bigi N, Des Georges M, Chiron R, Squalli-Houssaini AS, Claustres M, De Sario A. A balance between activating and repressive histone modifications regulates cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) expression in vivo. Epigenetics. 2014 Jul;9(7):1007-17. doi: 10.4161/epi.28967. Epub 2014 Apr 29. PMID: 24782114

    Lana E, Mégarbané A, Tourrière H, Sarda P, Lefranc G, Claustres M, De Sario A. DNA replication is altered in Immunodeficiency Centromeric instability Facial anomalies (ICF) cells carrying DNMT3B mutations. Eur J Hum Genet. 2012 Oct;20(10):1044-50. doi: 10.1038/ejhg.2012.41. Epub 2012 Feb 29. PMID: 22378288